MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 6962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	TAT	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009135	TA	3	6	2831	2836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009135	T	6	6	5428	5433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009135	T	7	7	5435	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009135	TAAATT	2	12	5457	5468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009135	ATT	2	6	5476	5481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009135	CCT	2	6	8229	8234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009135	ACC	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009135	ATT	2	6	9380	9385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009135	T	6	6	9384	9389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009135	AT	3	6	11054	11059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009135	TTA	2	6	11129	11134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009135	AT	4	8	11147	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009135	T	6	6	11169	11174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009135	AGTTA	2	10	11222	11231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009135	AT	3	6	11254	11259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009135	A	7	7	11269	11275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009135	T	8	8	12996	13003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009135	T	7	7	16245	16251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009135	AT	3	6	16253	16258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009135	CAT	2	6	16260	16265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009135	ATT	2	6	16269	16274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009135	AT	4	8	16281	16288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009135	AT	4	8	16318	16325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009135	TTG	2	6	16415	16420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009135	ACA	2	6	16425	16430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009135	T	6	6	18098	18103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009135	AAT	2	6	18118	18123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009135	TTTAT	2	10	18127	18136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009135	A	7	7	18181	18187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009135	CAA	2	6	18204	18209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009135	ATT	2	6	18214	18219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009135	AT	3	6	18363	18368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009135	AATT	2	8	18380	18387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009135	G	7	7	18410	18416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009135	GAA	2	6	18457	18462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009135	TCA	2	6	18527	18532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009135	TA	4	8	18559	18566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009135	TCCCT	2	10	18719	18728	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009135	T	6	6	18735	18740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009135	AAT	2	6	18748	18753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009135	T	6	6	18757	18762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009135	T	6	6	18785	18790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009135	ATATT	2	10	18804	18813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009135	TA	4	8	18843	18850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009135	GAA	2	6	18859	18864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009135	TAT	2	6	18872	18877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009135	ATC	2	6	18879	18884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009135	TAA	2	6	19462	19467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009135	ATT	2	6	20843	20848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009135	T	6	6	20851	20856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009135	T	6	6	20894	20899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009135	TA	3	6	20923	20928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009135	T	6	6	20952	20957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009135	TG	3	6	20998	21003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009135	TCA	2	6	21011	21016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009135	ATT	2	6	21048	21053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009135	GAT	2	6	21088	21093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009135	ATT	2	6	21127	21132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009135	GTT	2	6	21149	21154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009135	T	6	6	21153	21158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009135	A	6	6	21161	21166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009135	AGT	2	6	21169	21174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009135	TC	3	6	22689	22694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009135	TAATA	2	10	22709	22718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009135	TCTA	2	8	22726	22733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009135	T	8	8	23337	23344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009135	AAAT	2	8	23346	23353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009135	TTTAA	2	10	23362	23371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009135	AATT	2	8	23379	23386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009135	A	7	7	23398	23404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009135	ATT	2	6	24680	24685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009135	CCT	2	6	26792	26797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009135	T	6	6	26845	26850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009135	T	7	7	26866	26872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009135	AT	4	8	26950	26957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009135	TATT	2	8	26985	26992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009135	A	6	6	26995	27000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009135	TTA	2	6	27014	27019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009135	TAA	2	6	27031	27036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009135	T	6	6	27644	27649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009135	TA	3	6	27653	27658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009135	AATT	2	8	27671	27678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009135	AAG	2	6	27692	27697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009135	AT	3	6	27816	27821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009135	AT	3	6	27899	27904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009135	T	6	6	27924	27929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009135	A	7	7	29352	29358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009135	TAG	2	6	29359	29364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009135	ATTA	2	8	29367	29374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009135	T	6	6	29865	29870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009135	ATG	2	6	30356	30361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009135	TA	3	6	30386	30391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009135	ATT	2	6	30421	30426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009135	TATT	2	8	30433	30440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009135	TTAAT	2	10	30443	30452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009135	AT	4	8	30451	30458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009135	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009135	TA	3	6	30503	30508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009135	AAT	2	6	30520	30525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009135	TCC	2	6	33381	33386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009135	TTAT	2	8	33441	33448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009135	T	6	6	33450	33455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009135	TTA	2	6	33473	33478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009135	A	6	6	33511	33516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009135	AAT	2	6	33557	33562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009135	AAT	3	9	33566	33574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009135	AAT	2	6	33634	33639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009135	ATA	2	6	33650	33655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009135	TTAAA	2	10	33656	33665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009135	TTA	2	6	33669	33674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009135	ATT	2	6	33694	33699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009135	A	6	6	33729	33734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009135	GGA	2	6	33736	33741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009135	ATA	2	6	33742	33747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009135	AATTT	2	10	35036	35045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009135	ATT	2	6	35055	35060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009135	TAT	2	6	35083	35088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009135	T	6	6	35097	35102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009135	GAAA	2	8	37928	37935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009135	ATT	3	9	37967	37975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009135	ATT	2	6	37989	37994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009135	T	7	7	39284	39290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009135	A	6	6	40015	40020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009135	TTCT	2	8	41315	41322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009135	AT	3	6	41323	41328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009135	T	6	6	41332	41337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009135	ATA	2	6	41357	41362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009135	AAT	2	6	41372	41377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009135	GAG	2	6	42263	42268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009135	TAAA	2	8	43452	43459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009135	T	6	6	43477	43482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009135	TTTA	2	8	44968	44975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009135	A	6	6	45712	45717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009135	TAT	2	6	45721	45726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009135	T	9	9	47583	47591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009135	T	6	6	47593	47598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009135	AGT	2	6	47635	47640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009135	TAAA	2	8	47642	47649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009135	T	6	6	49027	49032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009135	TTA	2	6	49037	49042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009135	T	8	8	49060	49067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009135	A	7	7	49077	49083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009135	TA	4	8	49099	49106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009135	ATAC	2	8	49120	49127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009135	CAA	2	6	49150	49155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009135	TTCCT	2	10	50821	50830	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_009135	T	7	7	50830	50836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009135	ATA	2	6	50848	50853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009135	AT	3	6	50867	50872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009135	A	6	6	50875	50880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009135	ATA	2	6	50897	50902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_009135	ATT	2	6	110848	110853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_009135	T	6	6	111077	111082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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